क्रिस्टोफर ए. ब्यूडोइन*, टॉम एल. ब्लंडेल
एंटीबॉडी अनुकूली प्रतिरक्षा प्रणाली का एक आवश्यक घटक है जो बैक्टीरिया और परजीवी रोगजनकों जैसे विदेशी आक्रमणकारियों को बेअसर करने के लिए कार्य करता है। हालांकि, बी-सेल एपिटोप्स को अन्य प्रोटीन क्षेत्रों से उनकी सामान्य अप्रभेद्यता के कारण भविष्यवाणी करना मुश्किल है। अतीत में एपिटोप भविष्यवाणी उपकरण काफी हद तक अमीनो एसिड अनुक्रम समानता पर निर्भर रहे हैं; हालांकि, एपिटोप भविष्यवाणी एल्गोरिदम में तीन आयामी प्रोटीन संरचना विश्लेषण को लागू करने से पता लगाने की सटीकता में वृद्धि देखी गई है। इसके अलावा, क्रॉस-रिएक्टिव एंटीबॉडी को बांधने की उनकी क्षमता के लिए एंटीजेनिक प्रोटीन के बीच संरचनात्मक तुलना साहित्य में व्यापक रूप से नहीं खोजी गई है। हाल के अध्ययनों ने एंटीबॉडी क्रॉसरिएक्टिविटी की भविष्यवाणी करने में साझा एपिटोप संरचनाओं को देखने की उपयोगिता की ओर इशारा किया है, जो संक्रमण के बाद प्रेरित संक्रामक रोगजनकों और ऑटोइम्यून बीमारियों के बीच क्रॉस-इम्युनिटी पर प्रकाश डाल सकता है। इस प्रकार, यहाँ, साझा एपिटोप्स का पता लगाने में संरचनात्मक समानता तुलनाओं को शामिल करने के संभावित प्रभाव पर चर्चा की गई है। त्रि-आयामी कम्प्यूटेशनल प्रोटीन मॉडलिंग विधियों द्वारा बड़ी मात्रा में संरचनात्मक जानकारी निर्धारित किए जाने के साथ, इन विश्लेषणों को करने की क्षमता अधिक व्यवहार्य होती जा रही है।