जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

नॉनलाइनियर डायनेमिक्स कैओटिक मॉडल का उपयोग करके SARS-CoV-2 का विस्तारित विश्लेषण

लिन फैंग, शिनलेई वांग, झोंगयुआन लाई, डोंगडोंग झांग, मेंगकू वू, झिरुई पैन, ली वांग, कुन तांग, दाहोंग कियान, झेंडे हुआंग, ज़ुडोंग वांग, हैबो चेन

दो आयामी सेलुलर ऑटोमेटा (सीए) चित्र न्यूक्लियोटाइड और अमीनो एसिड अनुक्रमों को दर्शाने का एक वैकल्पिक तरीका है। यहाँ हमने दिखाया कि दो आयामी सीए चित्र जीन के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों (आधार अनुक्रम) और SARS-CoV-2 के जीनोम को स्पष्ट रूप से चित्रित कर सकते हैं, जो COVID-19 महामारी का रोगजनक एजेंट है। यदि आनुवंशिक कोडन नियमों का सख्ती से पालन किया जाता है, तो सीए चित्र आनुवंशिक कोडन को भी चित्रित कर सकते हैं और अप्रत्यक्ष रूप से SARS-CoV-2 के प्रोटीन के अमीनो एसिड अनुक्रमों को व्यक्त कर सकते हैं। सीए चित्र न्यूक्लियोटाइड या अमीनो एसिड अनुक्रमों के बीच समग्र और विस्तृत अंतर को प्रकट कर सकते हैं और वे अनुक्रम विवरणों के प्रति बहुत संवेदनशील होते हैं, जैसे कि TMPRSS2 जैसे होस्ट प्रोटीज़ की दरार पहचान साइट, और SARS-CoV-2 के स्पाइक प्रोटीन का रिसेप्टर बाइंडिंग डोमेन (RBD), जो SARS-CoV2 के विभिन्न उपभेदों के अनुक्रमों के बीच केवल एक अमीनो एसिड या न्यूक्लियोटाइड में होने वाले परिवर्तनों के प्रति भी संवेदनशील होते हैं। हमारा मानना ​​है कि CA चित्र वायरल आनुवंशिक और अमीनो एसिड अनुक्रम संदेशों के लिए गणितीय आधार प्रदान कर सकते हैं या SARS-CoV2 और अन्य वायरस के आनुवंशिक संदेशों को व्यक्त करते समय कृत्रिम बुद्धिमत्ता पर लागू हो सकते हैं।