वंशानुगत आनुवंशिकी: वर्तमान शोध

अमूर्त

अजैविक तनाव स्थितियों के तहत डेंड्रोबियम ऑफिसिनेल के Ty1-कोपिया समूह रेट्रोट्रांसपोसन का सक्रियण

कांग ली, युआन जियांग, यानहुई गाओ, जिनपिंग सी

यूनिवर्सल प्राइमर Ty1-कोपिया रेट्रोट्रांसपोसन रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस (RT) का उपयोग करके, लगभग 260 bp का संरक्षित रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस डोमेन, जो ठंडे तनाव और आसमाटिक तनाव से प्रेरित था, इस अध्ययन में डेंड्रोबियम ऑफ़िसिनेल से RTPCR द्वारा प्रवर्धित किया गया था, जो दर्शाता है कि रेट्रोट्रांसपोसन को तनाव की स्थिति से सक्रिय किया जा सकता है। एम्प्लीकॉन को पुनर्प्राप्त किया गया और संबंधित जैव सूचना विज्ञान सॉफ़्टवेयर द्वारा अनुक्रमण और विश्लेषण के लिए क्लोन किया गया। 78 Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन RTs ट्रांसक्रिप्शनल रूप से सक्रिय उच्च विषमता के साथ प्राप्त किए गए थे। इन अनुक्रमों की लंबाई 245 से 265 bp तक भिन्न थी, सभी अनुक्रम AT में समृद्ध थे और समरूपता 42.9% से 99.2% तक थी। जीनोम के Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन RT के लिए भी यही बात लागू होती है, तनाव की स्थिति से प्रेरित विभिन्न सिस-एक्टिंग विनियामक तत्व और CAAT बॉक्स, TATA बॉक्स संरक्षित अनुक्रमों और कुछ अन्य विनियामक तत्वों के अनुरूप प्रारंभिक प्रतिलेखन संकेत। रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस के तनाव की स्थिति से प्रेरित सिस-एक्टिंग विनियामक तत्व, Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन के ट्रांसक्रिप्शनल रूप से सक्रिय, जीनोम के Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन RT की तुलना में काफी अधिक थे। जब अमीनो एसिड में अनुवाद किया गया, तो कुछ अनुक्रमों ने स्टॉप कोडन उत्परिवर्तन या/और फ्रेमशिफ्ट उत्परिवर्तन प्रस्तुत किया, और सभी अनुक्रमों ने संरक्षित अनुक्रम "SLYGKQ" में उत्परिवर्तन प्रस्तुत किया। उनके अमीनो एसिड अनुक्रमों के संरेखण विश्लेषण के बाद फ़ाइलोजेनिक विश्लेषण के माध्यम से चार श्रेणियों की पहचान की गई, और जीनोम के Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन RT में कम समरूपता थी, जिसने संकेत दिया कि रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस ट्रांसक्रिप्शनल रूप से सक्रिय Ty1-कोपिया रेट्रोट्रांसपोसन, जो तनाव की स्थिति में प्रेरित होते हैं, जीनोम के Ty1-कोपिया जैसे रेट्रोट्रांसपोसन RT से काफी भिन्न थे।