फार्माकोजेनोमिक्स और फार्माकोप्रोटिओमिक्स जर्नल

अमूर्त

बायोमेडिकल साहित्य से फार्माकोजेनोमिक्स-विशिष्ट दवा-जीन जोड़े निकालने के लिए एक अर्ध-पर्यवेक्षित पैटर्न-शिक्षण दृष्टिकोण

रोंग जू और क्वानकिउ वांग

व्यक्तिगत चिकित्सा का अर्थ है सही रोगी को सही खुराक में सही दवा देना। फार्माकोजेनोमिक्स (PGx), आनुवंशिक वेरिएंट की पहचान करने का अध्ययन जो दवा प्रतिक्रिया को प्रभावित कर सकता है, व्यक्तिगत चिकित्सा के लिए महत्वपूर्ण है। जीन और दवा प्रतिक्रिया के बीच संबंधों का अध्ययन करने में कम्प्यूटेशनल दृष्टिकोण व्यक्तिगत चिकित्सा के लिए अनुसंधान के एक सक्रिय क्षेत्र के रूप में उभर रहे हैं। वर्तमान में, दवा-जीन संबंधों का व्यवस्थित अध्ययन सीमित है क्योंकि बड़े पैमाने पर मशीन द्वारा समझे जाने योग्य दवा-जीन संबंध ज्ञान आधार का निर्माण करना और उसे अपडेट रखना मुश्किल है। वैज्ञानिक साहित्य में दवा-जीन संबंधों की समृद्ध जानकारी होती है, इसलिए यह PGx अध्ययनों और व्यक्तिगत चिकित्सा के लिए अंतिम ज्ञान स्रोत है। हालाँकि, यह जानकारी सीमित मशीन समझ के साथ बड़े पैमाने पर मुक्त पाठ में दबी हुई है। बायोमेडिकल साहित्य से संरचित दवा-जीन संबंधों को निकालने के लिए स्वचालित दृष्टिकोण विकसित करने की आवश्यकता है। इस अध्ययन में, हम मेडलाइन से दवा-जीन संबंधों को निकालने के लिए एक अर्ध-पर्यवेक्षित दृष्टिकोण प्रस्तुत करते हैं। तकनीक एक बीज पैटर्न का उपयोग करती है और 20 मिलियन मेडलाइन सार में संबंध को व्यक्त करने के विभिन्न तरीकों को पुनरावृत्त करती है। हमारे दृष्टिकोण ने मेडलाइन से दवा-जीन संबंधों को निकालने में उच्च परिशुद्धता (0.961-1.00) हासिल की है और कई दवा-जीन जोड़े पाए हैं जो फार्मजीकेबी में उपलब्ध नहीं हैं, जो एक बड़े पैमाने पर मैन्युअल रूप से क्यूरेट किया गया पीजीएक्स ज्ञानकोष है।