जर्नल ऑफ माइक्रोबियल एंड बायोकेमिकल टेक्नोलॉजी

अमूर्त

सूक्ष्मजीवों की त्वरित पहचान के लिए एक नया वेब सर्वर

ओलिवियर क्रोस, फ्रेंकोइस शेवेनेट और रिचर्ड क्रिस्टन

छोटे सबयूनिट राइबोसोमल आरएनए (एसएसयू आरआरएनए) जीन अनुक्रम अब सूक्ष्मजीवी जीवों की पहचान करने के लिए व्यापक रूप से उपयोग किए जाते हैं। हालाँकि, सार्वजनिक डेटाबेस में अब ज्यादातर पीसीआर और पर्यावरण के नमूनों से अलग किए गए डीएनए की क्लोनिंग से उत्पन्न आरआरएनए जीन अनुक्रम शामिल हैं। इनमें से अधिकांश अनुक्रम खराब तरीके से एनोटेट किए गए हैं और उचित टैक्सोनोमिक असाइनमेंट नहीं हैं। नतीजतन, अनुक्रमों की यह बाढ़ नियमित पहचान को अक्सर बहुत थकाऊ बना देती है।
हम सूक्ष्मजीवी आइसोलेट्स की तेज़ और विश्वसनीय पहचान के लिए एक नया वेब सर्वर प्रस्तावित करते हैं। यह फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण के लिए आगे बढ़ने के लिए संबंधित अनुक्रमों और उनके वर्गीकरण को पुनः प्राप्त करने की अनुमति देता है। यह वेब टूल बैक्टीरिया, आर्किया और प्रोटोजोआ के लिए सुसंस्कृत प्रजातियों के विशिष्ट डेटाबेस पर आधारित है। इसके अलावा, पहचान प्रक्रिया में मदद करने वाले विभिन्न डेटा को डाउनलोड किया जा सकता है। सर्वर में एनोटेट किए गए फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों को स्वचालित रूप से प्रदर्शित करने के लिए ऑनलाइन सॉफ़्टवेयर भी शामिल है।