जर्नल ऑफ माइक्रोबियल एंड बायोकेमिकल टेक्नोलॉजी

अमूर्त

कोलोरेक्टल कैंसर में परिधीय रक्त की जीन अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल

ची-शुआन हुआंग, हार्न-जिंग टर्न, यू-चिन चाउ, सुई-लुंग सु, यू-टीएन चांग, ​​चिन-यू चेन, वोआन-जेन ली, चुंग-ताई याओ, ह्सिउ-लिंग चाउ, चिया-यी ली, चिएन-एन सन, चिंग-हुआंग लाई, लू पाई, ची-वेन चांग, ​​कांग-ह्वा चेन, थॉमस वेटर, युन-वेन शिह और ची-मिंग चू

पृष्ठभूमि: रक्त-आधारित परख में कोलोरेक्टल कैंसर (CRC) का पता लगाने के लिए इष्टतम आणविक मार्करों का मूल्यांकन किया गया। माइक्रोएरे तकनीक ने कोलोरेक्टल कैंसर अनुसंधान में एक बड़ी क्षमता दिखाई है। माइक्रोएरे अध्ययनों में कैंसर से महत्वपूर्ण रूप से जुड़े जीनों को अध्ययन में उम्मीदवार जीन के रूप में चुना गया था। इंटरनेट सार्वजनिक माइक्रोएरे डेटा सेट को पूल करने से पिछले अध्ययनों में नमूनों की कम संख्या की सीमा को दूर किया जा सकता है। उद्देश्य: सार्वजनिक माइक्रोएरे डेटा सेट का उपयोग करके कोलोरेक्टल कैंसर के लिए जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल की पुष्टि की जाती है। विधियाँ: लॉजिस्टिक रिग्रेशन विश्लेषण किया गया, और CRC और नियंत्रण के बीच प्रत्येक जीन के लिए ऑड्स अनुपात निर्धारित किए गए। GSE 4107, 4183, 8671, 9348, 10961, 13067, 13294, 13471, 14333, 15960, 17538, और 18105 के सार्वजनिक माइक्रोएरे डेटासेट में एडेनोकार्सिनोमा के 519 मामले और सामान्य म्यूकोसा के 88 नियंत्रण शामिल थे, जिनका उपयोग लॉजिस्टिक मॉडल से उम्मीदवार जीनों को सत्यापित करने और इसकी बाहरी व्यापकता का अनुमान लगाने के लिए किया गया था। परिणाम: CPEB4, EIF2S3, MGC20553, MAS4A1, ANXA3, TNFAIP6 और IL2RB के 7-जीन मॉडल को जोड़े में चुना गया, जिसने लॉजिस्टिक रिग्रेशन विश्लेषण (HL p=1.000, R2=0.951, AUC=0.999, सटीकता=0.968, विशिष्टता=0.966 और संवेदनशीलता=0.994) में सबसे अच्छे परिणाम दिखाए। निष्कर्ष: CRC के साथ एक नया जीन अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल जुड़ा हुआ था और संभावित रूप से रक्त आधारित पहचान परीक्षणों पर लागू किया जा सकता है।