जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

इथियोपिया, पूर्वी और मध्य अफ्रीका में कॉफी विल्ट रोग के एक कारक एजेंट, फ्यूजेरियम ज़ाइलारोइड्स का विशेष रूप से पता लगाने और निदान करने के लिए ट्रांसलेशन इलॉन्गेशन फैक्टर जीन का उपयोग करना ।

ओलाल एस, ओलांगो एन, किग्गुंडु ए, ओच्वो एस, एड्रिको जे, नान्तेज़ा ए, माटोवु ई, लुबेगा जीडब्ल्यू, कागेज़ी जी, हकीज़ा जीजे, वागोइरे डब्ल्यूडब्ल्यू, रदरफोर्ड एमए और ओपियो एसओ

वर्तमान अध्ययन एफ यूसेरियम ज़ाइलारियोइड्स (एनामॉर्फ: जी इबर्रेला ज़ाइलारियोइड्स) के विशिष्ट पता लगाने और निदान के लिए डीएनए-आधारित पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) के अनुप्रयोग पर पहली रिपोर्ट प्रस्तुत करता है। फ्यूसेरियम ज़ाइलारियोइड्स कॉफ़ी विल्ट रोग (ट्रेकियोमाइकोसिस) का प्रेरक एजेंट है, और यह रोग युगांडा में रोबस्टा कॉफ़ी उत्पादन में सबसे महत्वपूर्ण आर्थिक बाधा है। रोगज़नक़ की दो प्रजातियाँ हैं, एक रोबस्टा कॉफ़ी के लिए रोगजनक और दूसरी अरेबिका कॉफ़ी के लिए, और इसके विपरीत नहीं। इसका प्रयोगशाला निदान मुख्य रूप से माइक्रोस्कोपी पर आधारित है, जो धीमा है, इसमें खराब विभेदक शक्ति है, उच्च विशेषज्ञता की आवश्यकता है, केवल लक्षणों वाले मेजबान पौधों पर लागू है, और तब से मिट्टी से रोगज़नक़ का पता लगाने में विफल रहा है। संक्रमित रोबस्टा कॉफ़ी पौधे से अलग किए गए F. ज़ाइलारियोइड्स से ट्रांसलेशन एलॉन्गेशन फैक्टर-1α (TEF-1α) जीन को फ्यूसेरियम जीनस विशिष्ट प्राइमर द्वारा प्रवर्धित किया गया और फिर PCR उत्पाद को अनुक्रमित किया गया। फिर अनुक्रम डेटा का उपयोग विशिष्ट प्राइमर को डिज़ाइन करने के लिए किया गया। प्राइमर-ब्लास्ट उत्पाद केवल F. ज़ाइलारियोइड्स अनुक्रमों से मेल खाता पाया गया, जिसमें रोबस्टा के लिए 75% और अरेबिका कॉफ़ी के लिए 25% रोगजनक प्रजाति शामिल थी। पीसीआर द्वारा इन विट्रो परीक्षण से पता चला कि प्राइमर केवल F. ज़ाइलारियोइड्स के लिए विशिष्ट था, जो 284bp उत्पाद को बढ़ाता था और परीक्षण किए गए फ्यूजेरियम और अन्य पौधों के रोगजनकों की सभी निकट संबंधी प्रजातियों से F. ज़ाइलारियोइड्स को अलग करने में सक्षम था। इतना ही नहीं, यह युगांडा के विभिन्न क्षेत्रों से सभी F. ज़ाइलारियोइड्स आइसोलेट्स से डीएनए को बढ़ाने में सक्षम था, और 0.78 एनजी / µL के रूप में डीएनए सांद्रता को बढ़ाता था।