एडवांस्ड केमिकल इंजीनियरिंग जर्नल

अमूर्त

संरचना आधारित दवा डिजाइन पर क्रिस्टलीकरण की स्थिति, प्रोटीन निर्माण और अंतरिक्ष समूहों का प्रभाव

ओर्ली डाइम

एपो प्रोटीन और अवरोधकों वाले प्रोटीन की 3डी संरचना संरचना-आधारित दवा डिजाइन अध्ययनों के लिए आधार प्रदान करती है और अधिक शक्तिशाली दवा की खोज के लिए डॉकिंग प्रक्रियाओं में भी इसका उपयोग किया जाता है। एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी का उपयोग करके एसिटाइल कोलिनेस्टरेज़ (AChE) और फॉस्फोट्राइस्टरेज़ (PTE) की दवा डिजाइन के लिए विशिष्ट उदाहरण प्रस्तुत किए जाएंगे। कम्प्यूटेशनल डॉकिंग ड्रग डिज़ाइन दृष्टिकोण और AChE क्रिस्टल संरचनाओं के बीच तुलनात्मक विश्लेषण ने यह साबित किया कि एंजाइम के सक्रिय-साइट गॉर्ज के भीतर लिगैंड की स्थिति क्रिस्टलीकरण स्थितियों से प्रभावित होती है। स्पेक्ट्रोस्कोपिक साक्ष्य और थर्मल स्थिरता परिणामों ने लिगैंड पोजिशनिंग में इस तरह के अंतर का समर्थन किया। इन परिणामों का डॉकिंग प्रक्रियाओं का उपयोग करके संरचना-आधारित दवा डिजाइन के लिए निहितार्थ हैं। हमने एपो और कई फॉस्फोनेट (ओपी) एनालॉग की उन्नीस क्रिस्टल संरचनाओं का भी विश्लेषण किया जो कुछ अत्यधिक विकसित PTE वेरिएंट से बंधे हैं। विभिन्न पीटीई वेरिएंट के सक्रिय स्थल में ओपी के बंधन मोड के बारे में जानकारी प्रदान करने के अलावा, डेटा प्रोटीन अभिव्यक्ति के लिए उपयोग किए जाने वाले टैग के महत्व, 'उपयुक्त' क्रिस्टलीकरण स्थितियों का चयन, प्रोटीन निर्माण और अंतरिक्ष समूहों और संरचना-आधारित दवा डिजाइन के लिए उनके निहितार्थ को प्रकट करता है।