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K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं के हेमाटोपोइजिस में KLF3 की नियामक भूमिकाएँ

कियान झांग, नान डिंग, कियान जिओंग, जियावेन झेंग, ज़ेक्सिया ली, याजुआन ली, क्वानजेन ली, जियांगडोंग फांग और झाओजुन झांग

उद्देश्य: KLF3 (क्रुप्पेल-जैसा कारक 3) कोशिका वंश की एक विस्तृत श्रृंखला के विभेदन और विकास में शामिल है। हालाँकि, K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं के हेमटोपोइजिस में KLF3 की विनियामक भूमिकाएँ काफी हद तक अज्ञात हैं।
विधियाँ: सार्वजनिक जीन अभिव्यक्ति डेटाबेस जो तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया (AML) और तीव्र लिम्फोब्लास्टिक ल्यूकेमिया (ALL) रोग की विविधता का प्रतिनिधित्व करते हैं, NCBI में GEO डेटासेट से डाउनलोड किए गए थे। KLF3-कमी वाले K562 स्थिर कोशिकाओं की स्थापना की गई और माइक्रोएरे डेटासेट का विश्लेषण किया गया। KLF3-कमी वाले K562 कोशिकाओं में प्रभावित हेमटोपोइजिस-संबंधित जीन की पहचान करने के लिए जीन ऑन्टोलॉजी (GO) विश्लेषण का उपयोग किया गया था। प्रभावित हेमटोपोइजिस-संबंधित कार्यों, इंटरैक्शन नेटवर्क, मार्गों और भिन्न रूप से व्यक्त जीन (DEG) को शामिल करने वाले अपस्ट्रीम विनियामकों की पहचान करने के लिए इनजेनिटी पाथवेज एनालिसिस (IPA) का उपयोग किया गया था। KLF3-कमी वाले K562 कोशिकाओं को क्रमशः एरिथ्रोसाइट्स और मेगाकैरियोसाइट्स की ओर हेमिन और PMA के साथ प्रेरित किया गया, और फेनोटाइपिक विश्लेषण किए गए। हमने K562 कोशिकाओं के एरिथ्रोइड और मेगाकैरियोसाइट्स के विभेदन के दौरान KLF3 अभिव्यक्ति का विश्लेषण करने के लिए qPCR तकनीक का भी उपयोग किया।
परिणाम: हम रिपोर्ट करते हैं कि KLF3 रोगियों से प्राथमिक तीव्र ल्यूकेमिया ब्लास्ट कोशिकाओं में कम स्तर पर असामान्य रूप से व्यक्त किया जाता है जो ल्यूकेमिया कोशिकाओं के अपरिपक्व माइलॉयड या लिम्फोइड फेनोटाइप के संचय से जुड़े होते हैं। जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण से पता चलता है कि KLF3 K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं में हेमटोपोइजिस-संबंधित कार्यों में निकटता से शामिल है, और संभावित रूप से एरिथ्रोसाइट्स और मेगाकैरियोसाइट्स सहित विभिन्न रक्त कोशिका वंशों के हेमटोपोइजिस को नियंत्रित करता है। KLF3 संभवतः हेमटोलॉजिकल रोगों की विकृति से जुड़ा हुआ है। अंत में, कार्यात्मक विश्लेषण ने प्रदर्शित किया कि KLF3 की कमी K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं को एरिथ्रोइड और मेगाकैरियोसाइट भेदभाव की ओर ले जाती है, और K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं में हेमटोपोइजिस के शुरुआती चरण के लिए अपरिहार्य है। हमने संभावित तंत्रों का भी प्रस्ताव रखा है कि KLF3 K562 कोशिकाओं में हेमटोपोइजिस को नियंत्रित करता है।
निष्कर्ष: हमारे परिणामों से सबसे पहले पता चलता है कि KLF3 K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं के एरिथ्रोइड और मेगाकैरियोसाइट भेदभाव को नियंत्रित करता है, और KLF3 की कमी K562 ल्यूकेमिया कोशिकाओं में एरिथ्रोइड और मेगाकैरियोसाइट भेदभाव के शुरुआती चरण के लिए अपरिहार्य है।