जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

वास्तविक समय पी.सी.आर. का उपयोग करके मिट्टी और पौधों के नमूनों में फ्यूजेरियम यूडम का तेजी से पता लगाना और मात्रा का निर्धारण करना

सुकुमार मेसापोगु, बंदमारावुरी किशोर बाबू, अचला बख्शी, सोमसानी एस. रेड्डी, संगीता सक्सेना, आलोक के. श्रीवास्तव और दिलीप के. अरोड़ा

फ़्यूज़ेरियम यूडम के लिए वास्तविक समय पीसीआर आधारित जांच परख विकसित की गई, जो अरहर की दाल के संवहनी विल्ट का कारण बनती है। प्रजाति-विशिष्ट प्राइमर और जांच को डिजाइन करने के लिए एफ. यूडम के हिस्टोन-3 जीन को लक्षित किया गया था। विविध नमूनों से एफ. यूडम का पता लगाने और मात्रा निर्धारित करने के लिए एक विश्वसनीय और पुनरुत्पादनीय प्रक्रिया विकसित करने के लिए एक तुलनात्मक अध्ययन किया गया था। ऑलिगोन्युक्लियोटाइड्स की संवेदनशीलता और विशिष्टता का मूल्यांकन डॉट ब्लॉट हाइब्रिडाइजेशन, मानक और वास्तविक समय पीसीआर परख के माध्यम से किया गया था। जांच एचएफयूएसपी ने पर्यावरण डीएनए नमूनों की तुलना में एफ. यूडम की शुद्ध संस्कृतियों से प्राप्त डीएनए के लिए उच्च स्तर की संवेदनशीलता दिखाई। क्यूपीसीआर परख ने विशेष रूप से एफ. यूडम को फ्यूज़ेरियम, अन्य परीक्षण सूक्ष्मजीवों और पर्यावरण नमूनों की निकट संबंधी प्रजातियों से अलग किया। 84.17 पर एकल पिघलने वाला वक्र और 200 बीपी का एक मोनोमॉर्फिक बैंड पीसीआर परख की विशिष्टता और प्रामाणिकता को इंगित करता है। इस प्रकार, वास्तविक समय पीसीआर परख का उपयोग एक तेज़ और प्रभावी प्रक्रिया के रूप में किया जा सकता है जो जटिल वातावरण से एफ. उडुम की छोटी मात्रा का पता लगा सकता है। इसलिए, वर्तमान अध्ययन में प्रदर्शित वास्तविक समय पीसीआर परख का उपयोग अरहर के संवहनी विल्ट के प्रारंभिक संक्रमण और रोग महामारी विज्ञान के लिए एफ. उडुम का पता लगाने और निगरानी के लिए सफलतापूर्वक किया जा सकता है।