कार्सिनोजेनेसिस और उत्परिवर्तन जर्नल

अमूर्त

हेपेटोसेलुलर और संबंधित ADAR1-Hi कैंसर में उत्परिवर्तनीय जीनोमिक चालक के रूप में WA-साइटों पर ADAR1 A-से-I डीएमीनेशन के लिए संभावित साक्ष्य

रॉबिन ए. लिंडले, एडवर्ड जे. स्टील

हेपेटोसेलुलर कैंसर (HCC) में RNA संपादन एंजाइम ADAR1 की अत्यधिक अभिव्यक्ति होती है। इसके अलावा, HCC में प्रमुख जीनोमिक दैहिक उत्परिवर्तन हस्ताक्षर लगभग विशेष रूप से A:T बेस पेयर पर उत्परिवर्तन पर केंद्रित है, जहाँ A-से-G उत्परिवर्तन T-से-C उत्परिवर्तन (जब गैर-प्रतिलेखित स्ट्रैंड पर पढ़ा जाता है) से कहीं अधिक है। इस चरम प्रतिलेखन स्ट्रैंड पक्षपाती उत्परिवर्तन हस्ताक्षर के लिए एक स्पष्ट तंत्र, जो ADAR1 डेमिनेज की अत्यधिक अभिव्यक्ति से जुड़ा हुआ है, अभी तक स्पष्ट रूप से प्रदर्शित नहीं किया गया है। इस स्ट्रैंड पूर्वाग्रह के मानक विवरण को नाममात्र रूप से "प्रतिलेखन युग्मित क्षति" (TCD) कहा जाता है ताकि इसे अधिक पारंपरिक "प्रतिलेखन युग्मित मरम्मत" (TCR) से अलग किया जा सके। हम दिखाते हैं कि TCD विवरण आणविक साक्ष्य की सभी विशेषताओं को संतुष्ट नहीं करता है। पारंपरिक दृष्टिकोण यह है कि ADAR1 को प्रतिलेखों में डबल स्ट्रैंडेड RNA स्टेम-लूप संरचनाओं में इनोसिन (I) में संपादन के लिए WA-साइटों पर एडेनोसिन को लक्षित करने के लिए माना जाता है। यहां हम दिखाते हैं कि इन उत्परिवर्तन हस्ताक्षरों पर आणविक और कोशिकीय डेटा की समग्रता, ए:टी बेस जोड़े पर पक्षपाती उत्परिवर्तन विशेषताओं को प्रदर्शित करने वाले हेपेटोसेलुलर और संभवतः अन्य संबंधित ADAR1-Hi कैंसरों में उत्परिवर्तनीय चालक के रूप में WA-साइटों पर ADAR1-मध्यस्थता वाले A-से-I डीएमीनेशन की स्पष्ट भूमिका के लिए एक मजबूत संभावित साक्ष्य प्रदान करती है।