गोमासे वीएस, चितलांगे एनआर, शेरखाने एएस, चांगभाले एसएस और काले केवी
वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी एक धागे जैसा निमेटोड है जो लसीका फाइलेरिया के कारक कृमियों में से एक है जिसमें
लसीका और जननांग अंग अस्थायी या स्थायी रूप से अक्षम हो जाते हैं; आज तक लसीका फाइलेरिया के इलाज के लिए कोई प्रभावी दवा या टीका नहीं खोजा गया है। इस विश्लेषण में हमने लसीका फाइलेरिया के खिलाफ सिंथेटिक पेप्टाइड वैक्सीन डिजाइन के लिए वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी ट्रोपोनिन प्रोटीन से एंटीजेनिक पेप्टाइड्स की भविष्यवाणी की है क्योंकि एक ही प्रोटीन सबयूनिट के साथ बड़ी आबादी में प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया उत्पन्न की जा सकती है। विश्लेषण से पता चलता है कि वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी ट्रोपोनिन प्रोटीन के अनुमानित एपिटोप्स लसीका फाइलेरिया के खिलाफ सुरक्षा के लिए महत्वपूर्ण निर्धारक हैं। इस परख में हमने 136 अमीनो एसिड वाले वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी ट्रोपोनिन प्रोटीन की बंधन आत्मीयता का विश्लेषण किया है, जो 128 नॉनमर्स दिखाता है। इस शोध कार्य में, हमने दो अलग-अलग तरीकों से सीटीएल-एपिटोप्स की भविष्यवाणी की, जैसे कि एसवीएम (सपोर्ट वेक्टर मशीन) और एएनएन (आर्टिफिशियल न्यूरल नेटवर्क), एसवीएम आधारित भविष्यवाणी ने सोलह वैध एपिटोप्स दिखाए, जिनका इष्टतम स्कोर 0.36 कटऑफ पर 1.129 था, जबकि एएनएन आधारित भविष्यवाणी ने इकतीस वैध एपिटोप्स दिखाए, जिनका इष्टतम स्कोर 0.51 कटऑफ पर 1.000 था। हमने कैस्केड एसवीएम आधारित टीएपी बाइंडर और चार संभावित एंटीजेनिक एपिटोप्स की भी भविष्यवाणी की, जैसे कि 31-एलआरकेएलआईआरके-37, 49-डीईएफसीएएलवीवाईटीवीएएन-61, 87-एसआरपीटीएलकेएएलकेई-97, 108-ईएएवीडीई-113 (इष्टतम प्रवृत्ति 1.223) उच्चतम स्थानीय हाइड्रोफिलिसिटी के आधार पर भविष्यवाणी की गई; इसके अलावा हमने प्रयोगात्मक रूप से दो सबसे लंबे संभावित एपिटोप की तृतीयक संरचना की भी भविष्यवाणी की है जो
सिंथेटिक पेप्टाइड वैक्सीन डिजाइन के प्रति वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी ट्रोपोनिन प्रोटीन के अनुक्रम-संरचना-कार्य संबंध को समझने में हमारी सहायता कर सकते हैं। इस प्रकार ट्रोपोनिन प्रोटीन का एक छोटा सा टुकड़ा वुचेरेरिया बैनक्रॉफ्टी की गतिविधि के खिलाफ प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया उत्पन्न कर सकता है। इस दृष्टिकोण को सबयूनिट और सिंथेटिक पेप्टाइड वैक्सीन डिजाइन करने के लिए लागू किया जा सकता है