जीवविज्ञान और चिकित्सा

अमूर्त

एमटीएचएफआर जीन की होमोलॉजी मॉडल संरचनाओं का उपयोग करके कैंसर में दवा-लक्ष्य अंतःक्रिया की भविष्यवाणी करना

चौ. के.के., जमील के., राजू जी.एस.

फार्माकोजेनोमिक्स बायोइनफॉरमैटिक्स टूल्स का उपयोग करके अध्ययन करता है कि किसी व्यक्ति की आनुवंशिक संरचना दवाओं के प्रति शरीर की प्रतिक्रिया को कैसे प्रभावित करती है। हमारा उद्देश्य स्तन कैंसर की दवा मेटाबोलाइजिंग जीन जैसे MTHFR में संरचनात्मक भिन्नताओं की संभावित भूमिका को समझना था जो नियोप्लास्टिक दवाओं जैसे साइक्लोफॉस्फेमाइड, 5-फ्लूरोरासिल, मेथोट्रेक्सेट और अन्य के साथ निकटता से बातचीत करते हैं। हमने जीन में बहुरूपता की जांच की जो इन अणुओं की दवा बंधन क्षमता को प्रभावित कर सकती है। हमने SNPs के लिए NCBI के जीन संरचना और dbSNPs के बारे में जानकारी प्राप्त करने के लिए VEGA जीनोम ब्राउज़र का उपयोग किया। प्रोटीन अनुक्रम NCBI डेटाबेस से प्राप्त किया गया था और स्विस होमोलॉजी विधि का उपयोग करके प्रोटीन संरचना का निर्माण किया गया था। संरचना में उत्परिवर्तन का अध्ययन और निर्धारण करने के लिए लिनक्स आधारित सॉफ्टवेयर TRITON का उपयोग किया गया था। कीमोथेरेप्यूटिक एजेंटों की दवा बंधन क्षमताओं की विविधताओं की भविष्यवाणी करने के लिए, हमने मोलेग्रो वर्चुअल डॉकर का उपयोग किया। इस अध्ययन से पता चला कि प्रोटीन की उत्परिवर्तित MTHFR संरचनाओं के लिए बंधन ऊर्जा जंगली प्रकार के प्रोटीन की तुलना में अधिक थी। यह दर्शाता है कि संरचनात्मक संशोधनों का कारण बनने वाले उत्परिवर्तन ने विभिन्न लिगैंड्स (दवाओं) के साथ दवा बंधन ऊर्जा को संशोधित किया। इसलिए यह दर्शाता है कि प्रोटीन की संरचना में भिन्नता दवा-बंधन क्षमता को प्रभावित करती है और दवा-जीन इंटरैक्शन से संबंधित दवा विषाक्तता को भी प्रभावित करती है। यह इन दवा-जीन इंटरैक्शन के लिए पहली कम्प्यूटेशनल रिपोर्ट है। इस अध्ययन ने स्तन कैंसर के लिए आमतौर पर इस्तेमाल की जाने वाली कीमोथेरेप्यूटिक दवाओं में फार्माको-जीनोमिक इंटरैक्शन निर्धारित किया। यह दवा डिजाइनिंग या व्यक्तिगत रोगी की जीनोमिक प्रतिक्रिया के लिए उपयुक्त दवा का चयन करने के लिए एक मॉडल अध्ययन हो सकता है।