जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मानव स्टोमेटिन का आणविक मॉडलिंग और सिमुलेशन तथा इसकी झिल्ली एसोसिएशन के लिए भविष्यवाणियां

योसुके कोंडो, हिदेशी योकोयामा, इकुओ मात्सुई और सटोरू मियाज़ाकी

स्टोमेटिन मानव लाल रक्त कोशिकाओं में एक झिल्ली प्रोटीन है। क्रिस्टल संरचना, जिसमें हाइपरथर्मोफिलिक आर्कियन पाइरोकोकस होरिकोशी से मोनोमेरिक स्टोमेटिन में α/β डोमेन और सी-टर्मिनल α-हेलिकल सेगमेंट शामिल है, एक होमो-ट्रिमर बनाता है, और स्टोमेटिन को आगे उच्च क्रम के होमो-ऑलिगोमेरिक कॉम्प्लेक्स में व्यवस्थित किया जाता है, जिसमें 9- से 12-मर्स शामिल होते हैं। स्टोमेटिन के आणविक कार्यों को बेहतर ढंग से समझने के लिए, यह परिकल्पना मान्य की जानी चाहिए कि मानव स्टोमेटिन कैसे ऑलिगोमेराइज़ करता है और कोशिका झिल्लियों से जुड़ा होता है। यहाँ, हम रिपोर्ट करते हैं कि मानव स्टोमेटिन के α-हेलिकल सेगमेंट की लचीलेपन का अनुमान लगाकर स्टोमेटिन संरचना से क्या अनुरूपताएँ उत्पन्न की जा सकती हैं। और हम यह भी अनुकरण करते हैं कि मानव स्टोमेटिन की ऑलिगोमेरिक संरचना कोशिका झिल्लियों के साथ कैसे इंटरैक्ट करती है। परिणामों से पता चला कि α-हेलिकल सेगमेंट लचीली हरकतें कर सकते हैं; मोनोमर का α-हेलिकल सेगमेंट और α/β डोमेन एक सपाट संरचना बना सकता है, और ट्रिमर के α-हेलिकल सेगमेंट लिपिड झिल्ली तक पहुँच सकते हैं। मानव स्टोमेटिन की सपाट संरचना के आधार पर, हमने कोशिका झिल्ली की सतह के साथ बातचीत करने के लिए एक काल्पनिक ओलिगोमेरिक मॉडल प्रस्तावित किया। ओलिगोमेरिक मॉडल अच्छी तरह से समझाता है कि स्टोमेटिन कोशिका झिल्ली को सहारा देने के लिए एक मचान प्रोटीन के रूप में कार्य करता है।