जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

टेनिया ओविस से एमएचसी बाइंडिंग पेप्टाइड के संवेदनशील मात्रात्मक पूर्वानुमानों के लिए माइक्रोबियल प्रोटिओमिक्स दृष्टिकोण

गोमासे वी.एस. और चितलांगे एन.आर.

टेनिया ओविस एक टैपवार्म परजीवी है, जिसका वयस्क चरण कुत्तों की आंतों में पाया जाता है, जबकि मध्यवर्ती या लार्वा चरण भेड़ की मांसपेशियों में पाया जाता है, जो भेड़ों में खसरा का कारण बनता है। एंटीजन प्रोटीन के पेप्टाइड टुकड़ों का उपयोग तर्कसंगत वैक्सीन डिज़ाइन में उपयोग के लिए नॉनमर्स का चयन करने और संक्रामक रोगों में प्रतिरक्षा प्रणाली की भूमिकाओं की समझ बढ़ाने के लिए किया जा सकता है। विश्लेषण से पता चलता है कि टेनिया ओविस से एंटीजन प्रोटीन के एमएचसी वर्ग II बाइंडिंग पेप्टाइड्स परजीवी संक्रमण से मेजबान की सुरक्षा के लिए महत्वपूर्ण निर्धारक हैं। इस परख में, हमने एंटीजन डिज़ाइन के लिए PSSM और SVM एल्गोरिदम का उपयोग किया और 254 अमीनो एसिड वाले एंटीजन प्रोटीन की बाइंडिंग आत्मीयता का अनुमान लगाया, जो 246 नॉनमर्स दिखाता है। मेजर हिस्टोकंपैटिबिलिटी कॉम्प्लेक्स (MHC) वर्ग I और II अणुओं के लिए एंटीजन पेप्टाइड्स की बाइंडिंग क्षमता का अनुमान भेड़ के खसरे के खिलाफ वैक्सीन के विकास में महत्वपूर्ण है।