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वायरल रोगजनक औषधीय और पर्यावरणीय दोनों पहलुओं के संबंध में अधिक महत्वपूर्ण सूक्ष्मजीव हैं क्योंकि यह मनुष्यों, अधिकांश जानवरों और पौधों में कई बीमारियों का कारण बनता है। इसलिए, वायरल प्रजातियों की पहचान करने और वायरल रोगों के लिए निदान विधियों को खोजने के लिए वायरल रोगजनकों पर व्यापक अध्ययन किए जाते हैं। कल्चर्ड सेल मोनोलेयर्स, एंटीबॉडी न्यूट्रलाइजेशन टेस्ट और पीसीआर जैसे आणविक तरीकों सहित वायरल रोगजनकों का पता लगाने के लिए इस्तेमाल की जाने वाली पारंपरिक विधियों की कमियों के कारण ; 'मेटाजेनोमिक पहचान' नामक एक तेज़, सस्ती और उभरती हुई तकनीक पेश की गई है।