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अमूर्त

पूर्वी कोलकाता वेटलैंड से पृथक नाइट्रिफाइंग बैक्टीरिया के लिए amoA और nxrA के साथ 16S rRNA जीन अनुक्रमों का तुलनात्मक विश्लेषण स्थापित करने का परिचय: एक अंतर्राष्ट्रीय रामसर साइट

साहा एम, सरकार ए और बंधोपाध्याय बी

नाइट्रोजन चक्र पृथ्वी पर जीवन के लिए सबसे जटिल और महत्वपूर्ण है। नाइट्रोजन चक्रण प्रक्रिया को अंजाम देने वाले नाइट्रिफाइंग बैक्टीरिया जल गुणवत्ता नियंत्रण में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं, इस प्रकार नाइट्रिफाइंग बैक्टीरिया की आनुवंशिक परिवर्तनशीलता की निगरानी और निगरानी के लिए जीनोमिक फिंगरप्रिंट डेटाबेस बनाना बहुत महत्वपूर्ण है और पश्चिम बंगाल के विभिन्न क्षेत्रों में स्थित भेरियों के लिए जैव सुरक्षा प्रोटोकॉल स्थापित करना भी बहुत महत्वपूर्ण है। वर्तमान में अमोनिया ऑक्सीडाइजिंग बैक्टीरिया (एओबी) और नाइट्राइट ऑक्सीडाइजिंग बैक्टीरिया (एनओबी) के विकासवादी संबंध और प्राकृतिक विविधता मुख्य रूप से 16 एस आरआरएनए और पूर्वी कोलकाता वेटलैंड में अमोनिया मोनोऑक्सीजिनेज (एमोए) और नाइट्राइट ऑक्सीडोरेडक्टेस (एनएक्सआरए) के सक्रिय साइट पॉलीपेप्टाइड को एन्कोड करने वाले उनके जीन के तुलनात्मक अनुक्रम विश्लेषण पर आधारित है। इसलिए, कार्यात्मक मार्करों (amoA या nxrA) में से किसी एक का उपयोग अमोनिया ऑक्सीडाइज़र का पता लगाने के लिए किया जा सकता है या संरचनात्मक मार्कर (16S rDNA) का उपयोग पर्यावरणीय अध्ययनों में विशिष्ट प्रजातियों का पता लगाने के लिए किया जा सकता है। इन तकनीकों में प्राकृतिक AOB और NOB आबादी को चिह्नित करने और उनकी टैक्सोनोमिक और फायलोजेनेटिक विशेषताओं का विश्लेषण करने के लिए 16S rDNA जीन का उपयोग शामिल था। तुलनात्मक 16S rRNA अनुक्रम विश्लेषण द्वारा स्थापित AOB और NOB फायलोजेनी की वर्तमान धारणा को जीन amoA और nxrA जीन का उपयोग करके स्वतंत्र रूप से पुष्टि की जा सकती है और एक वैकल्पिक फायलोजेनेटिक मार्कर के रूप में साबित किया जा सकता है। हमारे काम का उद्देश्य EKW में 16S rDNA अनुक्रम विश्लेषण के साथ AOBs और NOBs के लिए कार्यात्मक मार्कर के रूप में अमोनिया मोनोऑक्सीजिनेज सबयूनिट A जीन (amoA) पारिस्थितिक निगरानी के लिए, वर्तमान शोध कार्य के अंतर्गत नाइट्रिफाइंग बैक्टीरिया के लिए विशिष्ट amoA और nxrA जैसे जीन अधिक विश्वसनीय उपकरण हो सकते हैं।