जर्नल ऑफ माइक्रोबियल एंड बायोकेमिकल टेक्नोलॉजी

अमूर्त

डीएनए बारकोड द्वारा ट्राइकोडर्मा प्रजाति की पहचान और सेल्यूलोलिटिक गतिविधि की जांच

अब्देलमेगिड आई फहमी, रागा ए ईसा, खलील ए अल-हल्फावी, हनाफी ए हमजा और महमूद एस हेलवा

मिस्र के नील डेल्टा के विभिन्न स्थानों से ट्राइकोडर्मा के पृथकों की प्रजाति पहचान की गई और उनकी सेल्युलोलिटिक गतिविधियों का विश्लेषण किया गया। रूपात्मक विशेषताओं के आधार पर, 75% पृथकों की पहचान प्रजाति स्तर पर की गई और उन्हें चार समग्र समूहों में विभाजित किया गया। ट्राइकोडर्मा प्रजातियों की सटीक पहचान करने के लिए केवल रूपात्मक लक्षण वर्णन अपर्याप्त था क्योंकि उनके पास अपेक्षाकृत कम रूपात्मक लक्षण और सीमित भिन्नता है जो पृथकों के ओवरलैपिंग और गलत पहचान का कारण बनती है। इसलिए, रूपात्मक लक्षण वर्णन की सीमाओं की भरपाई के लिए आणविक तकनीक का उपयोग करने की आवश्यकता थी। 5.8S-ITS क्षेत्र की डीएनए अनुक्रमणिका को विशिष्ट प्राइमर ITS1 और ITS4 का उपयोग करके किया गया था। BLAST प्रोग्राम का उपयोग करके GenBank में जमा किए गए अनुक्रमों के साथ 5.8S-ITS क्षेत्र के अनुक्रमों की तुलना करके सभी पृथकों को कम से कम 99% के होमोलॉजी प्रतिशत के साथ प्रजाति स्तर पर पहचाना जा सकता है। इसके अलावा, जेनबैंक की विश्वसनीयता का आकलन करने के लिए ट्राइकोकी सर्च टूल का इस्तेमाल किया गया और परिणाम BLAST परिणामों से 92% सहमत थे। डेटा ने एक संकीर्ण प्रजाति विविधता का संकेत दिया और दो मुख्य प्रजातियां प्रमुख थीं; टी. लॉन्गिबार्किएटम और टी. हरजियानम। न्यूक्लियोटाइड्स का वितरण, साथ ही साथ आइसोलेट्स के ITS क्षेत्र में (G+C) सामग्री, अंतर-प्रजाति भिन्नता की एक विस्तृत श्रृंखला का संकेत देती है। अंत में, सेल्यूलोज-एज़्योर विधि का उपयोग करके उनके कुल सेल्यूलेज गतिविधियों के लिए, एविसेल विधि का उपयोग करके एक्सोग्लूकेनेस गतिविधि के लिए और कार्बोक्सिमिथाइल सेल्यूलोज (CMC) और एसिड सूजे हुए सेल्यूलोज विधियों का उपयोग करके एंडोग्लूकेनेस गतिविधि के लिए आइसोलेट्स का मूल्यांकन किया गया। परिणामस्वरूप, सेल्यूलोलिटिक क्षमता के लिए उपयोग किए गए 28 आइसोलेट्स में से ग्यारह आइसोलेट्स को सर्वश्रेष्ठ आइसोलेट्स के रूप में चुना गया।