फार्माकोजेनोमिक्स और फार्माकोप्रोटिओमिक्स जर्नल

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एकल-अणु वास्तविक समय अनुक्रमण मायोटोनिक डिस्ट्रोफी प्रकार 1 में रोग का निदान और आनुवंशिक परामर्श कैसे बेहतर कर सकता है

स्टेफ़नी टोमे

मायोटोनिक डिस्ट्रोफी टाइप 1 (DM1) अस्थिर CTG दोहराव के विस्तार से उत्पन्न होता है जो आमतौर पर पीढ़ियों में और समय के साथ दैहिक ऊतकों में बढ़ता है। CTG दोहराव अस्थिरता और DM1 नैदानिक ​​अभिव्यक्तियाँ दोहराव की लंबाई और दोहराए गए अनुक्रम की शुद्धता पर निर्भर करती हैं। DM1 में आनुवंशिक परामर्श बहुत जटिल है, अत्यधिक परिवर्तनशील नैदानिक ​​प्रस्तुति और CTG विस्तार के आकार और शुद्धता को निर्धारित करने में तकनीकी कठिनाइयों के कारण। हमने DM1 रोगियों में नैदानिक ​​और आनुवंशिक परिवर्तनशीलता को समझने के लिए बड़े CTG दोहराव आकार को सटीक रूप से मापने और विस्तारित एलील के अनुक्रम रुकावटों की पहचान करने के लिए पैकबायो सिंगल-मॉलेक्यूल रियल-टाइम अनुक्रमण (SMRT) का उपयोग किया। हमने शुद्ध एम्प्लीकॉन से सीक्वल I और II सिस्टम पर 130 से लेकर 1000 CTG दोहराव तक के CTG दोहराव विस्तार वाले कई DM1 रोगियों का अनुक्रम किया। हमने प्रति सैंपल 77% से अधिक पूर्ण DM1 रीड प्राप्त किए, जिसमें विस्तारित एलील से 70% से अधिक रीड थे। डेटा में सभी नमूनों के लिए अपेक्षित आकार सीमा में लंबे रीड शामिल हैं, जिसमें 1000 से अधिक CTG दोहराव वाले DM1 रोगी शामिल हैं (तालिका 1 और संदर्भ 1)। SMRT अनुक्रमण बड़े ट्रिपल रिपीट विस्तार को अनुक्रमित करने, CTG दोहराव रुकावटों की पहचान करने और DM1 रोगियों में दैहिक मोज़ेसिज्म का अनुमान लगाने के लिए बहुत आशाजनक है। यह विधि रोगियों को दी जाने वाली रोगनिदान और परामर्श में महत्वपूर्ण रूप से सुधार कर सकती है।