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आरएनए हस्तक्षेप (आरएनएआई) पौधों में जीन फ़ंक्शन को स्पष्ट करने और वांछित लक्षणों के लिए जीन अभिव्यक्ति को बदलने के लिए एक शक्तिशाली उपकरण है। होस्ट-प्रेरित जीन साइलेंसिंग (एचआईजीएस) एक आरएनएआई-आधारित प्रक्रिया है, जहाँ पौधे में बने छोटे आरएनए पौधे पर हमला करने वाले कीटों या रोगजनकों के जीन को चुप करा देते हैं। छोटे आरएनए आम तौर पर ट्रांसजेनिक पौधों में डबल स्ट्रैंडेड आरएनए (डीएसआरएनए) का उत्पादन करके बनाए जाते हैं, लेकिन प्रायोगिक उद्देश्यों के लिए डीएसआरएनए को एग्रोबैक्टीरियम या वायरस के साथ पौधे की कोशिकाओं में पेश किया जा सकता है जो डीएसआरएनए के माध्यम से प्रतिकृति बनाते हैं। पौधों में कीट प्रतिरोध के लिए जीन साइलेंसिंग दृष्टिकोण का आज तक केवल वायरस प्रतिरोध के लिए ही व्यावसायीकरण किया गया है।