जैव रसायन एवं विश्लेषणात्मक जैव रसायन

अमूर्त

लीजियोनेला न्यूमोफिला मुर्बी रिडक्टेस के डॉकिंग और मोटोरोला ज्वालामुखी के लिए ये ब्लॉक डिजाइन

वाणी प्रियदर्शिनी, दिव्यभाबा प्रधान, मन्ने मुनिकुमार, अमिनेनी उमामहेश्वरी, डी राजशेखर और पीवीलीन श्रीनिवास राव

लीजियोनेला न्यूमोफिला लीजियोनेयर्स रोग, निमोनिया और जीवन के लिए खतरा पैदा करने वाले प्रोस्थेटिक वॉल्व एंडोकार्ट का कारण है। कोशिका भित्ति के एक घटक पेप्टाइडोग्लाइकन के लिए महत्वपूर्ण एंजाइमों में से एक, एमयूआरबी रिडक्टेस को लीजियोनेला न्यूमोफिला सहित बैक्टीरिया के खिलाफ आम औषधि लक्ष्य के रूप में स्थापित किया गया था। FAD के साथ MurB रिडक्टेस एक सहकारक के रूप में काम करता है और UDP-N-एसिटाइलनॉल पाइरुविलग्लूकोसामिन (UDP-GlcNAcEP) के UDP-N-एसिटाइलमुरैमिक एसिड में NADPH-निर्भर कमी को उत्पन्न करता है। वर्तमान अध्ययन में, मेस्ट्रो v9.2 के ऑब्जेक्टिव वर्कफ़्लो में वर्कान्विट ग्लाइड v5.7 के क्रमिक रोल का उपयोग करके FAD के 360 एनालॉग्स को लीजियोनेला न्यूमोफिला के MurB रिडक्टेस में डॉक किया गया था। डॉकिंग एनालिसिस के माध्यम से प्राप्त सीड लीड में, केवल लीड1 (XPGscore -13.27Kcal/mol) में कोफ़ेक्टर FAD (XPGscore -13.25Kcal/mol) की तुलना में MurB रिडक्टेस के प्रति बेहतर बॉन्ड आकर्षण पाए गए। MurB रिडक्टेस- लीड1 डॉकिंग कॉम्प्लेक्स के शेयरधारक स्तर की अंतःक्रियाओं ने MurB रिडक्टेस- FAD कॉम्प्लेक्स के साथ अच्छा सहसंबंध दिखाया। इसके अलावा, विभिन्न समय-सीमाओं पर डॉकिंग कॉम्प्लेक्स के प्राकृतिक लेजर लेजर डॉकिंग कॉम्प्लेक्स के लिए डेसमंड v3.0 का उपयोग करके मर्ब रिडक्टेस-लीड 1 डॉकिंग कॉम्प्लेक्स के लिए रॉकेट रॉकेट दागे गए। MurB रिडक्टेस- लीड 1 कॉम्प्लेक्स के परमाणु ऊर्जा संयंत्र ने डॉकिंग इंटरएक्टिव की स्थिर प्रकृति दिखाई दी।