जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

कशेरुकी माइटोकॉन्ड्रियल कार्बोनिक एनहाइड्रेज़ (CA5) जीन और प्रोटीन का तुलनात्मक अध्ययन: स्तनधारियों में जीन दोहराव का साक्ष्य जिसमें CA5A यकृत विशिष्ट है और CA5B व्यापक रूप से व्यक्त है और X-गुणसूत्र पर स्थित है

रोजर एस होम्स

स्तनधारी कार्बोनिक एनहाइड्रेस (सीए) (ईसी 4.2.1.2) के कम से कम पंद्रह परिवार कार्बन डाइऑक्साइड के हाइड्रेशन और संबंधित कार्यों को उत्प्रेरित करते हैं। सीए5ए और सीए5बी जीन विशिष्ट माइटोकॉन्ड्रियल एंजाइमों को एनकोड करते हैं और अमोनिया डिटॉक्सिफिकेशन और ग्लूकोज मेटाबोलिज्म सहित आवश्यक जैव रासायनिक भूमिकाएं निभाते हैं। कशेरुकी जीनोम परियोजनाओं से डेटा का उपयोग करके सीए5ए और सीए5बी जीन और प्रोटीन के लिए अमीनो एसिड अनुक्रमों, द्वितीयक संरचनाओं और जीन स्थानों की भविष्यवाणी करने के लिए जैव सूचनात्मक तरीकों का उपयोग किया गया था। सीए5ए और सीए5बी जीन में आमतौर पर प्रत्येक जांचे गए कशेरुकी जीनोम के लिए 7 कोडिंग एक्सॉन होते हैं। मानव सीए5ए और सीए5बी सबयूनिट में क्रमशः 305 और 317 अमीनो एसिड होते हैं, जिनमें माइटोकॉन्ड्रियल ट्रांजिट पेप्टाइड्स सहित प्रमुख अमीनो एसिड अवशेष होते हैं; तीन जिंक बाइंडिंग साइट्स (हिस130, हिस132, हिस155); और एक टायर164 सक्रिय साइट। कशेरुकी CA5 जीन परिवारों के फीलोजेनेटिक विश्लेषणों से पता चला कि यह कशेरुकी विकास में एक प्राचीन जीन है, जो स्तनधारी पूर्वजों के जीनोम में जीन दोहराव की घटना से गुजरा था, जिससे मोनोट्रेम, मार्सुपियल और यूथेरियन स्तनधारियों में CA5A और CA5B जीन परिवार बने। CA5A मुख्य रूप से यकृत में व्यक्त किया गया था, जबकि CA5B में एक विस्तृत ऊतक वितरण प्रोफ़ाइल थी, यह X-गुणसूत्र पर स्थानीयकृत था और स्तनधारी विकास के दौरान अधिक संरक्षित था।