एमपी शाह
हमने पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) का उपयोग करके सक्रिय कीचड़ में अमोनिया-ऑक्सीडाइजिंग बैक्टीरिया (एओबी) के समुदायों की जांच की, उसके बाद टर्मिनल प्रतिबंध खंड लंबाई पॉलीमॉर्फिज्म (टी-आरएफएलपी), क्लोनिंग और अमोनिया मोनोऑक्सीजिनेज जीन (एएमओए) के अल्फा-सबयूनिट की अनुक्रमण। इस अध्ययन में पीसीआर द्वारा अमोनिया ऑक्सीडाइज़र 16 एस आरडीएनए टुकड़ों के विशिष्ट प्रवर्धन की तकनीक, डिनेचुरिंग ग्रेडिएंट जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस (डीजीजीई) द्वारा मिश्रित पीसीआर नमूनों को अलग करना, और ऑलिगोन्युक्लियोटाइड जांच के साथ विशिष्ट संकरण द्वारा बैंड पहचान को स्थान और समय पर कई नमूनों की समुदाय संरचना की तुलना करने की अनुमति देने के लिए जोड़ा गया था। डीएनए अलगाव, पुनः प्रवर्धन, अनुक्रम निर्धारण और फ़ायलोजेनेटिक विश्लेषण के लिए रुचि के डीजीजीई बैंड भी निकाले गए। हमने उभरते मैक्रोफाइट ग्लिसरिया मैक्सिमा द्वारा मासिक नमूनों की तुलना की ताकि यह पता लगाया जा सके कि पौधे की जड़ों और ऑक्सीजन की उपलब्धता का β-उपसमूह अमोनियाऑक्सीडाइज़र आबादी पर मौसमी प्रभाव हो सकता है। इसी तरह, अलग-अलग स्थानों से ऑक्सीजन की उपलब्धता में भिन्नता वाले पाँच मिट्टी या तलछट के नमूनों की तुलना की गई। हालाँकि पहले से परिभाषित दो नाइट्रोसोस्पिरा अनुक्रम समूहों की उपस्थिति को जांचे गए नमूनों में अलग-अलग तरीके से पहचाना जा सकता था, लेकिन किसी विशेष समूह के लिए कोई सबूत नहीं था जो समय-समय पर एनोक्सिक वातावरण के लिए विशिष्ट था।