किफ़ल बेलाचेव, डेमेलाश टेफ़री और लेगेसी हागोस
इसके महत्व के अलावा कॉफी उत्पादन में कई जैविक कारक बाधाएँ हैं जिनमें रोग प्रमुख हैं। कॉफी कई रोगों से ग्रस्त है जो फलों, पत्तियों, तनों और जड़ों पर हमला करते हैं, और उपज और विपणन क्षमता को कम करते हैं। इथियोपिया में प्रमुख कॉफी रोग कॉफी बेरी रोग (कोलेटोट्रीकम कहवाए), कॉफी विल्ट रोग (गिबेरेला ज़ाइलारियोइड्स) और कॉफी लीफ रस्ट (हिमालिया वेस्टेट्रिक्स) हैं, हालांकि, बाकी रोगों को मामूली माना जाता है। कॉर्टिसियम कोलेरोगा के कारण कॉफी का थ्रेड ब्लाइट भारत में कॉफी का एक महत्वपूर्ण रोग है। इथियोपियाई कॉफी में थ्रेड ब्लाइट रोग पहली बार 1978 में गेरा और मेटू कृषि अनुसंधान उप-स्टेशनों में दर्ज किया गया था। हालांकि यह जून और सितंबर के बीच छिटपुट रूप से होता अध्ययन के परिणामों से पता चला कि अलग हुए कॉफी पौधों पर रोग सिंड्रोम कॉफी के थ्रेड ब्लाइट के समान था जिसे अब तक दर्ज किया गया है और खेत में देखा गया है। यह रोग हमेशा कॉफी के पत्तों, शाखाओं, टहनियों और जामुनों पर विशिष्ट ब्लाइट लक्षणों के साथ हमला करता है। कॉफी के पेड़ों के युवा तनों और रसीले कोमल ऊतकों पर सफेद फफूंद के धागे देखे गए। ये धागे अंततः गहरे भूरे रंग के हो जाते हैं और पत्तियों के नीचे की तरफ फैल जाते हैं जबकि संक्रमित शाखाओं पर कॉफी के जामुन भी पूरी तरह से नष्ट हो जाते हैं जिससे पूरी फसल बर्बाद हो जाती है। पत्तियों, जामुन, शाखाओं और टहनियों के नमूनों से कारण रोगजनक को अलग करने और पहचानने से लगातार फफूंद की प्रजातियाँ उत्पन्न हुईं जो कॉर्टिसियम कोलेरोगा हो सकती हैं जो रोगजनकता परीक्षणों से और भी साबित हुई हैं। " गमर " के लिम्मू कॉफी बागान फार्म में पहले प्रकोप (2008) के दौरान रोग की औसत घटना और गंभीरता क्रमशः 49.02 और 9.8% थी। रोगों का दूसरा प्रकोप "डिसाडिस" फार्म (2012) के बेबेका कॉफी एस्टेट से रिपोर्ट किया गया था। दक्षिण-पश्चिम, पश्चिम और दक्षिण इथियोपिया के प्रमुख कॉफ़ी उत्पादक क्षेत्रों में वर्तमान क्षेत्र-व्यापी प्रकोप 2014 में था, जिसका औसत प्रकोप और गंभीरता क्रमशः 58.44 और 32.59% थी, जिसके परिणामस्वरूप काफी नुकसान हुआ। अन्य कारकों के अलावा, लंबे समय तक बारिश और नमी की लंबी अवधि ने थ्रेड ब्लाइट रोग के प्रकोप को बढ़ावा दिया, जिसका अर्थ है कि वर्तमान जलवायु परिवर्तन परिदृश्य इथियोपिया में अरेबिका कॉफ़ी उत्पादन पर चुनौतीपूर्ण बीमारियों का पक्ष ले रहे हैं।