जैव रसायन एवं विश्लेषणात्मक जैव रसायन

अमूर्त

एक कुशलतापूर्वक तह करने वाला विशुद्ध रूप से सममित डी नोवो डिज़ाइन किया गया प्रोटीन

माइकल ब्लैबर

कई गोलाकार प्रोटीन फोल्ड कुछ प्रकार की घूर्णी समरूपता प्रदर्शित करते हैं - सबसे आम उदाहरण टीआईएम बैरल है (जिसमें दोहराए जाने वाले बीटा-स्ट्रैंड/टर्न/अल्फा-हेलिक्स/टर्न मोटिफ की 8 गुना घूर्णी समरूपता है)। प्रोटीन में इस प्रकार की सामान्य समरूपता एक्स-रे संरचना अध्ययन के शुरुआती दिनों से ही स्पष्ट थी, जिससे यह परिकल्पना हुई कि जीन दोहराव और संलयन अंतर्निहित विकासवादी तंत्र था। हालांकि, जबकि 3°- संरचना स्तर पर ऐसी समरूपता स्पष्ट है, दोहराए जाने वाले संरचनात्मक रूपांकनों की तुलना करते समय कोई भी 1°-संरचना समरूपता अक्सर बड़े पैमाने पर अनुपस्थित होती है। इस तरह के अनुक्रम विश्लेषण, सटीक दोहराए जाने वाले रूपांकनों के लिए फोल्डिंग निराशा के सैद्धांतिक विचारों के साथ-साथ कम अनुक्रम जटिलता वाले पेप्टाइड्स के लिए मूल रूप से असंरचित गुणों (जैसा कि सटीक दोहराए जाने वाले रूपांकनों के साथ होता है) के परिणामस्वरूप एक प्रतिमान सामने आया कि यह देखते हुए कि सटीक समरूपता प्रोटीन डिजाइन में निहित दहनशील विस्फोट की समस्या को काफी हद तक कम कर सकती है, तथा ऐसी समस्याओं को असंभव से गणना-योग्य बना सकती है, विशुद्ध रूप से सममित डी-नोवो डिजाइन किए गए प्रोटीनों के लिए कुशल तह के प्रदर्शन ने काफी रुचि पैदा की।