जर्नल ऑफ बैक्टीरियोलॉजी एंड पैरासिटोलॉजी

अमूर्त

कार्यात्मक अंतःक्रिया नेटवर्क विश्लेषण के आधार पर माइकोबैक्टीरियम ट्यूबरकुलोसिस , माइकोबैक्टीरियम लेप्री और माइकोबैक्टीरियम स्मेगमैटिस की प्रणाली स्तरीय तुलना

रिचर्ड ओ अकिनोला, गैस्टन के माज़ंडु और निकोला जे मुल्डर

माइकोबैक्टीरियम लेप्री एक रोगजनक बैक्टीरिया है जो कुष्ठ रोग का कारण बनता है, एक ऐसा रोग जो मुख्य रूप से त्वचा, परिधीय तंत्रिकाओं, आँखों और ऊपरी श्वसन पथ के म्यूकोसा को प्रभावित करता है। मल्टी-ड्रग थेरेपी (MDT) रणनीति के माध्यम से इस बीमारी को रोकने के लिए पिछले कुछ वर्षों में दर्ज की गई महत्वपूर्ण प्रगति के बावजूद, हर साल इस बीमारी के नए मामले सामने आते हैं। विश्व स्वास्थ्य संगठन के अनुसार, 2011 की शुरुआत में 192,242 नए मामले थे। माइकोबैक्टीरियम लेप्री को प्रयोगशाला में संवर्धित नहीं किया जा सकता है, लेकिन इसे कुष्ठ रोग के प्रति इसकी संवेदनशीलता के कारण माउस फुट पैड और हाल ही में नौ बैंडेड आर्मडिलोस में उगाया जा सकता है। इसका अत्यधिक कम किया गया जीनोम इसे माइकोबैक्टीरियल जीनस के भीतर रिडक्टिव इवोल्यूशन के लिए एक मॉडल के रूप में एक दिलचस्प प्रजाति बनाता है; यह माइकोबैक्टीरियम ट्यूबरकुलोसिस (MTB) के साथ एक ही पूर्वज साझा करता है। MTB के लिए एक कार्यात्मक नेटवर्क पहले से ही तैयार किया गया था और नेटवर्क के टोपोलॉजिकल गुणों के आधार पर जीव के जैविक संगठन को प्रकट करने के लिए व्यापक कम्प्यूटेशनल विश्लेषण किए गए थे। यहाँ, हम एक अन्य धीमी गति से बढ़ने वाले माइकोबैक्टीरियम लेप्री (एमएलपी) और तेजी से बढ़ने वाले गैर-रोगजनक माइकोबैक्टीरियम स्मेगमैटिस (एमएसएम) के लिए प्रोटीन कार्यात्मक नेटवर्क बनाने के लिए सार्वजनिक डेटाबेस से जीनोमिक अनुक्रम और कार्यात्मक डेटा का उपयोग करते हैं। एमटीबी नेटवर्क के साथ मिलकर, यह विभिन्न आकार के जीनोम वाले तीन माइकोबैक्टीरिया की तुलना करने का अवसर प्रदान करता है। इस पेपर में, हम सिस्टम बायोलॉजी स्तर पर इन जीवों के बीच अंतर को मापने और नेटवर्क बायोलॉजी और विकास का अध्ययन करने के लिए एमटीबी, एमएलपी और एमएसएम की व्यवस्थित रूप से तुलना करने के लिए नेटवर्क केंद्रीयता उपायों का उपयोग करते हैं।